Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

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Length 824 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ift88Q61371 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ift88Q61371 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ift88Q61371 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ift88Q61371 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ift88Q61371 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ift88Q61371 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ift88Q61371 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ift88Q61371 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ift88Q61371 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ift88Q61371 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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