Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cln3Q61124 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Cln3Q61124 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Cln3Q61124 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Cln3Q61124 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Cln3Q61124 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cln3Q61124 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Cln3Q61124 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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