Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gbp4Q61107 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gbp4Q61107 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gbp4Q61107 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gbp4Q61107 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gbp4Q61107 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gbp4Q61107 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbp4Q61107 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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