Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a3Q5XF89 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a3Q5XF89 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms