Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Trim38Q5SZ99 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Trim38Q5SZ99 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Trim38Q5SZ99 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Trim38Q5SZ99 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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