Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r196Q5SVD5 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r196Q5SVD5 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r196Q5SVD5 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r196Q5SVD5 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r196Q5SVD5 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r196Q5SVD5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms