Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH3

Cdh12, Cadherin-12, mousemouse

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Length 794 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh12Q5RJH3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdh12Q5RJH3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms