Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms