Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa20Q45VN2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms