Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
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Dnah12Q3V0Q1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Dnah12Q3V0Q1 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
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Dnah12Q3V0Q1 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Dnah12Q3V0Q1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Dnah12Q3V0Q1 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnah12Q3V0Q1 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms