Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Bmx-201ENSMUST00000112263 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Gm44531-201ENSMUST00000208364 2000 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Ncoa7-210ENSMUST00000217138 2192 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Ttc39c-204ENSMUST00000169401 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Npnt-205ENSMUST00000117456 3383 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Srek1ip1-201ENSMUST00000022230 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Rassf9-202ENSMUST00000219445 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
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SvipQ3UZP4 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Fxyd5-207ENSMUST00000161684 1172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
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SvipQ3UZP4 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
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SvipQ3UZP4 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
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SvipQ3UZP4 Kng2-202ENSMUST00000100046 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
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SvipQ3UZP4 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
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SvipQ3UZP4 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
SvipQ3UZP4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SvipQ3UZP4 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC8.83□□□□□ -1
SvipQ3UZP4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
SvipQ3UZP4 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SvipQ3UZP4 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SvipQ3UZP4 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC8.83□□□□□ -1
SvipQ3UZP4 Gimap8-203ENSMUST00000203509 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SvipQ3UZP4 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
SvipQ3UZP4 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SvipQ3UZP4 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SvipQ3UZP4 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SvipQ3UZP4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SvipQ3UZP4 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
SvipQ3UZP4 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
SvipQ3UZP4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SvipQ3UZP4 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
SvipQ3UZP4 Mbd1-201ENSMUST00000097530 2833 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
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