Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
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D130052B06RikQ3UW13 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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D130052B06RikQ3UW13 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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D130052B06RikQ3UW13 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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D130052B06RikQ3UW13 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
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D130052B06RikQ3UW13 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
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D130052B06RikQ3UW13 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
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D130052B06RikQ3UW13 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
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D130052B06RikQ3UW13 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
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D130052B06RikQ3UW13 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
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D130052B06RikQ3UW13 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
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D130052B06RikQ3UW13 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
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D130052B06RikQ3UW13 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D130052B06RikQ3UW13 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
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