Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U595 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U595 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U595 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U595 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U595 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U595 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U595 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U595 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U595 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U595 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U595 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Q3U595 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U595 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U595 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U595 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U595 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U595 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U595 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U595 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U595 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U595 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U595 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U595 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U595 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U595 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U595 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U595 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U595 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U595 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U595 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U595 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U595 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U595 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U595 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U595 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U595 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U595 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U595 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U595 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U595 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U595 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U595 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U595 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U595 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U595 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U595 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U595 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U595 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U595 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U595 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U595 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U595 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U595 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U595 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q3U595 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U595 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U595 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U595 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U595 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U595 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U595 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U595 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U595 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U595 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U595 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U595 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U595 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U595 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U595 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U595 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U595 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U595 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U595 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U595 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U595 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U595 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U595 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U595 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U595 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U595 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U595 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U595 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U595 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U595 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U595 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U595 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U595 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U595 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U595 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U595 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U595 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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