Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk3Q3U3Q1 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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