Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms