Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms