Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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