Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Prr27Q3SYJ2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Prr27Q3SYJ2 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Prr27Q3SYJ2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prr27Q3SYJ2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms