Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Cpne9Q1RLL3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Cpne9Q1RLL3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Cpne9Q1RLL3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Cpne9Q1RLL3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Cpne9Q1RLL3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Cpne9Q1RLL3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Cpne9Q1RLL3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Cpne9Q1RLL3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cpne9Q1RLL3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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