Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Traf3ip1Q149C2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
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Traf3ip1Q149C2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Traf3ip1Q149C2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Traf3ip1Q149C2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3ip1Q149C2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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