Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim24Q0VG18 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms