Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisal1Q0VBP7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms