Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf541Q0GGX2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms