Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pate4Q09098 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pate4Q09098 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms