Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms