Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms