Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp11Q02853 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp11Q02853 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp11Q02853 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp11Q02853 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp11Q02853 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp11Q02853 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp11Q02853 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Mmp11Q02853 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp11Q02853 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp11Q02853 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp11Q02853 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp11Q02853 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp11Q02853 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp11Q02853 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp11Q02853 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp11Q02853 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Mmp11Q02853 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Mmp11Q02853 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Mmp11Q02853 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Mmp11Q02853 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Mmp11Q02853 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Mmp11Q02853 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Mmp11Q02853 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Mmp11Q02853 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp11Q02853 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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