Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms