Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde1bQ01065 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms