Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms