Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms