Protein–RNA interactions for Protein: Q00547

Hmmr, Hyaluronan mediated motility receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmmrQ00547 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmmrQ00547 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms