Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms