Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms