Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx3P81067 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx3P81067 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx3P81067 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx3P81067 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx3P81067 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx3P81067 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx3P81067 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx3P81067 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx3P81067 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx3P81067 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx3P81067 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms