Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Irx2P81066 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Irx2P81066 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Irx2P81066 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Irx2P81066 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Irx2P81066 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Irx2P81066 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Irx2P81066 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms