Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms