Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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