Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeboxP70368 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeboxP70368 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms