Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf5P70191 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf5P70191 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf5P70191 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf5P70191 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf5P70191 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf5P70191 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf5P70191 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf5P70191 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf5P70191 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms