Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrch1P62046 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms