Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga11P61622 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga11P61622 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga11P61622 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga11P61622 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Itga11P61622 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Itga11P61622 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Itga11P61622 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga11P61622 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Itga11P61622 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Itga11P61622 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Itga11P61622 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga11P61622 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga11P61622 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga11P61622 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itga11P61622 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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