Protein–RNA interactions for Protein: P61092

Siah1a, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1A, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1aP61092 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah1aP61092 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Siah1aP61092 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms