Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms