Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms