Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms