Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TdgP56581 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TdgP56581 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TdgP56581 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TdgP56581 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TdgP56581 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TdgP56581 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TdgP56581 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TdgP56581 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TdgP56581 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TdgP56581 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TdgP56581 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TdgP56581 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TdgP56581 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TdgP56581 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TdgP56581 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TdgP56581 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TdgP56581 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TdgP56581 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TdgP56581 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TdgP56581 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TdgP56581 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TdgP56581 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TdgP56581 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TdgP56581 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TdgP56581 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TdgP56581 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TdgP56581 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TdgP56581 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TdgP56581 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TdgP56581 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TdgP56581 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TdgP56581 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TdgP56581 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TdgP56581 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TdgP56581 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TdgP56581 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TdgP56581 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TdgP56581 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TdgP56581 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TdgP56581 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TdgP56581 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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TdgP56581 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TdgP56581 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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TdgP56581 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TdgP56581 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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TdgP56581 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TdgP56581 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TdgP56581 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TdgP56581 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TdgP56581 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TdgP56581 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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TdgP56581 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TdgP56581 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TdgP56581 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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TdgP56581 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TdgP56581 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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TdgP56581 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TdgP56581 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TdgP56581 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TdgP56581 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TdgP56581 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TdgP56581 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TdgP56581 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TdgP56581 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TdgP56581 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TdgP56581 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TdgP56581 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TdgP56581 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TdgP56581 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TdgP56581 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TdgP56581 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TdgP56581 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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TdgP56581 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TdgP56581 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TdgP56581 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TdgP56581 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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TdgP56581 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TdgP56581 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TdgP56581 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TdgP56581 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TdgP56581 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TdgP56581 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TdgP56581 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms