Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CartptP56388 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CartptP56388 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CartptP56388 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CartptP56388 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CartptP56388 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CartptP56388 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CartptP56388 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CartptP56388 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CartptP56388 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CartptP56388 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CartptP56388 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CartptP56388 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CartptP56388 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CartptP56388 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CartptP56388 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CartptP56388 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CartptP56388 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CartptP56388 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CartptP56388 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CartptP56388 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CartptP56388 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CartptP56388 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CartptP56388 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CartptP56388 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CartptP56388 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CartptP56388 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CartptP56388 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CartptP56388 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CartptP56388 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CartptP56388 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CartptP56388 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CartptP56388 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CartptP56388 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CartptP56388 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CartptP56388 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CartptP56388 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CartptP56388 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CartptP56388 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CartptP56388 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CartptP56388 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CartptP56388 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CartptP56388 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CartptP56388 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CartptP56388 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CartptP56388 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CartptP56388 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CartptP56388 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CartptP56388 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CartptP56388 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CartptP56388 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CartptP56388 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CartptP56388 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CartptP56388 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CartptP56388 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CartptP56388 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CartptP56388 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CartptP56388 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CartptP56388 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CartptP56388 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CartptP56388 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CartptP56388 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CartptP56388 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CartptP56388 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CartptP56388 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CartptP56388 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CartptP56388 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CartptP56388 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CartptP56388 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CartptP56388 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CartptP56388 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CartptP56388 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CartptP56388 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CartptP56388 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CartptP56388 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CartptP56388 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CartptP56388 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CartptP56388 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CartptP56388 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CartptP56388 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CartptP56388 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CartptP56388 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CartptP56388 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CartptP56388 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CartptP56388 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CartptP56388 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CartptP56388 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CartptP56388 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CartptP56388 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CartptP56388 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CartptP56388 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CartptP56388 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CartptP56388 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CartptP56388 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CartptP56388 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CartptP56388 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CartptP56388 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CartptP56388 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CartptP56388 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CartptP56388 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms