Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NcanP55066 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NcanP55066 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NcanP55066 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NcanP55066 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NcanP55066 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NcanP55066 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NcanP55066 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NcanP55066 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NcanP55066 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NcanP55066 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NcanP55066 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NcanP55066 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NcanP55066 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NcanP55066 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NcanP55066 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NcanP55066 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NcanP55066 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NcanP55066 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NcanP55066 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NcanP55066 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NcanP55066 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NcanP55066 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NcanP55066 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NcanP55066 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NcanP55066 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NcanP55066 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NcanP55066 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NcanP55066 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NcanP55066 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NcanP55066 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NcanP55066 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NcanP55066 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NcanP55066 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NcanP55066 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NcanP55066 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NcanP55066 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NcanP55066 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NcanP55066 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NcanP55066 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NcanP55066 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NcanP55066 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NcanP55066 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NcanP55066 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NcanP55066 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NcanP55066 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NcanP55066 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NcanP55066 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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NcanP55066 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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