Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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